UST COV-2模型

引入用于在马尼拉covid-19流行病乌斯COV-2模型

流行病学模型是一种数学工具,尝试通过检查它是如何在过去传播预测病毒大流行的未来行为。在这个项目中,我们描述了我们的努力,在马尼拉covid-19大流行的模型。

我们已经决定把重点放在菲律宾国家首都区,不仅因为它是全国人口心脏其中超过全国人口的十分之一的活,而且还因为它一直以来,到目前为止,菲律宾大流行的流行病学震中:为2020年5月21日,8659案件(占全国的64%)和621例死亡(73%)已报告在马尼拉。

我们开始与德尔福模型,机器学习能力流行病学模型上个月在开发的麻省理工学院在美国和适应它,这样它可以被用于研究的大流行和ECQ在国家首都地区的影响。我们写说明我们所谓的科学论文 UST COV-2模型,已上载至medrxiv.org。我们将很快提交它的同行评审。

-bernhard egwolf和尼卡纳·奥斯特里科,o.p.

简单来说

在NCR ECQ实施的影响

如图1,政府强加的增强社区检疫(ECQ)似乎是由显著降低covid-19案件总数和死亡总人数有限,在马尼拉大流行的影响。

作为比较点,马尼拉和纽约市,与可比人群两大都市区,记录在2020年3月11日从covid-19社会上流传他们的第一例死亡,分别和3月13日,2020年。然而,马尼拉输入锁定于2020年3月15日,在纽约市等了一个星期为5月3月20日,2020年进入其锁定21年,2020年,马尼拉报道从covid-19,而纽约621个总死亡人数全市确诊16232例死亡总数。 这表明,早期实施ECQ的是能够挽救成千上万人的生命在NCR。我们赞扬公共卫生部门的努力.

图1。 造型增强社区检疫(ECQ)在马尼拉covid-19大流行的影响。总covid-19例,为国家首都地区总死亡人数预测评估没有锁定,并与由菲律宾卫生部门提供的数据增强社会隔离。

 

上平坦化covid-19的第一波

如图2所示,出现大流行的第一波被后退。 曲线似乎已经被夷为平地:预报的积极病例数达到峰值早在5月,是逐渐下降。 目前,对流感大流行的第二波没有证据。

然而,曲线的扁平化是不显着的。其实,很显然,在ECQ正在努力抑制流感大流行,即,带动,感染病例数下降到零。以这样的速度,该模型预测,在马尼拉案件总数将继续逐步提高并不会高原多月,但活跃的情况下预测的数量也将减少。如果保持目前的检疫措施,covid-19的活跃情况下,预测数字将不会跌破1000的情况下,直到九月初这一年。

在一些城市的NCR ECQ有效性

如图3所示,我们的模型显示,ECQ的有效性已经在整个NCR差别很大。像马卡蒂,曼达卢永,并帕拉纳克城市已经较为成功的抑制covid-19社会上流传的不是马尼拉和奎松市。

如果保持目前的检疫措施,病例总数在7月中旬在曼达卢永在马卡蒂业绩预增高原,由8月初,由九月帕拉纳克。然而,同样不能说后两个城市。尽管地方当局的努力值得称赞,病例总数预计将逐渐保持多月增加,但活跃的情况下预测的数量也将减少。

目前尚不清楚为什么ECQ一直没有有效同时在马尼拉市和奎松市,因为它已经在其邻近的城市,特别是因为当地政府一直在努力压抑自己的感染率。他们不是在NCR的前两名最密集的城市,因此不太可能独自吸引人口密度来解释。尽管如此,这两个城市地区都经历了好几倍高感染人数比在首都地区的其他组成部分的城市。因此,这也不是没有道理认为,在马尼拉covid-19大流行的动态正由当地流行病驱动。它表明,公共卫生部门应加大努力遏制在这两个城市的NCR大流行。

马尼拉过渡到GCQ的预测的影响

如图4,很显然,与GCQ代替ECQ将增加,感染病例和死亡人数在马尼拉的预测数。然而,要强调的是,这些增长不是不可避免的是很重要的。他们可以用严格的跟踪偏移,检测和跟踪提供程序,它通过破坏病毒的传播链寻求限制社会上流传。我们承认,国家和地方当局一直在努力增加在菲律宾的测试能力,在过去两个月,我们赞赏他们的努力。

给出的观测,通常,只有20%的人口有助于潜在的至少80%的传播传染疾病,我们建议跟踪,测试,并在马尼拉跟踪程序着力抓好限制superspreading事件的影响( SSE的),其与两个爆炸性增长在后期阶段爆发和持续传输早相关联。

我们有多少测试需要?怎么样接触者追踪?

多少测试和跟踪能力将需要在马尼拉保持流行病在海湾?一队来自美国哈佛大学的学者最近发表的建议为不同规模的社区和控制其流行疾病的不同阶段。他们建议用温和的感染率,即在其人口活动性病毒的不到1%的患病率每一个直辖市 - 在大多数情况下,NCR看似满足这一标准 - 要雇用五示踪剂60支球队每每死亡一天,他们在社区的观察,并保持2500个测试每一天,每一个死亡的测试能力。

在2020年5月22日,平均运行记录在马尼拉每天死亡的七天是每天6人死亡。 这意味着,在这个阶段,大流行,根据哈佛小组的建议,NCR将需要的的每天15,000个测试和1800接触示踪剂分散在整个地区的呼叫中心工作的测试能力,以控制当地的流行病。 这个测试和接触者追踪能力的地理分布应该对应于每个马尼拉等城市的地方流行病的严重程度,特别侧重于马尼拉市和奎松市的。

值得注意的是,科学与工程学院的在圣托马斯正在开发一种设计方案,以创建可以使用另作它用集装箱货车平板卡车运移动covid-19测试实验室的大学教师。我们建议LGU在马尼拉考虑通过在他们的城市移动测试这个设计方案。

用于在covid-19模型和引用到主文献更详细地,参见:哈德egwolf和尼卡纳·奥斯特里科,OP,medrxiv ID#“的covid-19流行在马尼拉的移动性制导建模”:medrxiv /十一万一千六百一十七分之二千零二十零。上传到2020年5月26日。

 

资源

 

medrvix.org链接

研究人员

转。尼卡诺尔码头乔治austriaco,o.p.,博士,s.th.d.

FR。尼卡纳·奥斯特里科,o.p.,是在修士传道,也被称为多明尼加顺序的顺序的至公教士。出生在菲律宾,他完成了学士学位,在生物工程,以优异成绩,学位宾夕法尼亚大学,然后获得了博士学位。来自麻省理工学院生物学在那里他是霍华德休斯医学研究所的研究员。在完成他的博士学业,FR后。 austriaco正好在英国伦敦大学学院的路德维希癌症研究所国际人类前沿科学计划的研究员。

在1997年,下一个更深层次的转换主,FR。 austriaco进入修士传教士的秩序的见习期。他完成了两个他的宗座学士学位在神圣的神学和他的主人在圣母无原罪在研究在华盛顿特区的多明尼加房子宗座学院的神学学位,在2003年他被祝圣为神父于2004年5月21日。他完成了他在研究在华盛顿特区的多明尼加房子,在道德神学神圣的神学(STL)宗座许可证,并在神圣的神学(STD)一宗座博士学位,在瑞士弗里堡大学。 FR。 austriaco获得了m.b.a.从2020年普罗维登斯学院。

FR。 austriaco目前担任天意生物学教授和神学在普罗维登斯学院,罗德岛。他也是在在圣托马斯的在菲律宾马尼拉大学中心宗教学和伦理学研究员和thomisticevolution.org主任。他在普罗维登斯学院NIH资助的实验室正在研究程序性细胞死亡的使用酵母遗传学,酿酒酵母和白色念珠菌,作为模式生物。 FR。 austriaco是一个生物伦理学顾问,为天主教主教会议的美国和菲律宾。

FR。 austriaco已发表在生物学,哲学和神学五十同行评议的论文,两本书,其中包括。生物医药和至福:介绍天主教伦理学,这被认为是由大学与研究图书馆协会2012年选择优秀学术称号。在畅销书的第二版预计在2021年。

协会。教授。伯恩哈德egwolf,博士。汇率。 NAT。

协会。教授。数学和物理系的伯恩哈德egwolf持有医生物理学学位自然科学, 优等生来自德国慕尼黑,在那里他还获得了大学文凭在物理路德维希·马克西米利安大学。

作为生物物理学家,他的研究兴趣上理论和计算生物物理学面向朝向研究,离子通道蛋白,从高维仿真数据熵验算,和药物分子的分子对接的计算机模拟。他的研究已经发表在知名期刊,如计算化学杂志,生物化学杂志,和分子生物学杂志,等等。

博士。 egwolf在从德国研究基金会接收准许参加了一个为期两年的博士后研究基金在芝加哥大学,美国,2007年。目前,他是在研究中心的赢咖2的自然和应用科学的研究人员。